Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPB2P35606 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPB2P35606 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPB2P35606 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms