Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-FP30511 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms