Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCAP28676 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GCAP28676 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms