Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms