Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms