Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNCP24863 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNCP24863 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNCP24863 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNCP24863 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNCP24863 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNCP24863 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNCP24863 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNCP24863 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNCP24863 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNCP24863 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms