Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRDP23468 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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