Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK11BP21127 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms