Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms