Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2B1P20020 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B1P20020 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms