Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS1P17812 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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