Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPB42P16452 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPB42P16452 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPB42P16452 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.2 ms