Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPCAMP16422 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms