Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH1P12830 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH1P12830 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH1P12830 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH1P12830 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH1P12830 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH1P12830 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH1P12830 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH1P12830 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH1P12830 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH1P12830 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms