Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TPRP12270 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRP12270 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRP12270 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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