Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DMDP11532 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DMDP11532 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DMDP11532 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DMDP11532 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DMDP11532 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DMDP11532 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DMDP11532 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DMDP11532 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DMDP11532 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DMDP11532 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DMDP11532 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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