Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB1P11230 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms