Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF2P04141 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF2P04141 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF2P04141 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF2P04141 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF2P04141 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF2P04141 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF2P04141 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF2P04141 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSF2P04141 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF2P04141 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF2P04141 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF2P04141 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF2P04141 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF2P04141 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF2P04141 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF2P04141 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF2P04141 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF2P04141 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF2P04141 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF2P04141 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF2P04141 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF2P04141 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF2P04141 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF2P04141 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF2P04141 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms