Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms