Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms