Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NDUFS4O43181 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NDUFS4O43181 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NDUFS4O43181 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NDUFS4O43181 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NDUFS4O43181 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NDUFS4O43181 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NDUFS4O43181 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NDUFS4O43181 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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NDUFS4O43181 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NDUFS4O43181 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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