Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNPHO15079 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SNPHO15079 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SNPHO15079 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SNPHO15079 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SNPHO15079 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNPHO15079 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SNPHO15079 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SNPHO15079 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SNPHO15079 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 CCL11-201ENST00000305869 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNPHO15079 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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