Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRPO00253 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRPO00253 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRPO00253 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRPO00253 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRPO00253 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRPO00253 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRPO00253 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRPO00253 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRPO00253 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRPO00253 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRPO00253 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRPO00253 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRPO00253 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRPO00253 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRPO00253 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRPO00253 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRPO00253 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms