Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms