Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms