Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms