Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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LINC00587B1AMM8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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LINC00587B1AMM8 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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LINC00587B1AMM8 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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LINC00587B1AMM8 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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LINC00587B1AMM8 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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LINC00587B1AMM8 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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LINC00587B1AMM8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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