Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms