Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP164Q9UPV0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms