Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD1BQ9UPS6 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms