Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms