Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB23Q9ULC3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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