Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLN8Q9UBY8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms