Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS29Q9UBQ0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms