Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms