Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms