Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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CNTN3Q9P232 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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CNTN3Q9P232 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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CNTN3Q9P232 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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CNTN3Q9P232 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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CNTN3Q9P232 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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CNTN3Q9P232 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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CNTN3Q9P232 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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CNTN3Q9P232 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN3Q9P232 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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