Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HACD3Q9P035 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms