Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOMER3Q9NSC5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms