Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASXL3Q9C0F0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms