Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms