Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF6Q9BYE7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms