Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms