Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOPXQ9BPY8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms