Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms