Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPF18Q99633 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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