Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAT1Q99536 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAT1Q99536 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms