Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms