Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C2orf48Q96LS8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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