Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 SUGP1-201ENST00000247001 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ZBTB20-212ENST00000474710 2757 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AOC1-207ENST00000493429 3135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 BCAS3-202ENST00000407086 3496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 LINC00052-201ENST00000560153 1966 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 FCGR3A-206ENST00000443193 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CCDC36-204ENST00000452691 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 HIRIP3-201ENST00000279392 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ANKEF1-202ENST00000378392 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 GOLGA6L10-208ENST00000619556 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 JAK3-207ENST00000534444 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 GIT2-204ENST00000361006 5444 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 SLC45A4-202ENST00000517878 3470 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 IGHMBP2-201ENST00000255078 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PLXNA3-201ENST00000369682 10885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 APLF-201ENST00000303795 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 FAM131A-201ENST00000310585 3677 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 DCT-202ENST00000446125 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 RNF6-203ENST00000381588 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 STK26-201ENST00000354719 3179 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms